Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm20425E9Q035 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms