Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ddx60E9PZQ1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
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Ddx60E9PZQ1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ddx60E9PZQ1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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