Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Srp54bE9PXC0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Srp54bE9PXC0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Srp54bE9PXC0 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Srp54bE9PXC0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Srp54bE9PXC0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Srp54bE9PXC0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Srp54bE9PXC0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Srp54bE9PXC0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Srp54bE9PXC0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms