Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3002E9PW72 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms