Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5W0

Atp6ap1l, ATPase, H+-transporting, lysosomal accessory protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6ap1lD3Z5W0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atp6ap1lD3Z5W0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms