Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms