Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gm3543D3Z235 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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