Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc6D3YZP9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Ccdc6D3YZP9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Ccdc6D3YZP9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Ccdc6D3YZP9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc6D3YZP9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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