Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc170D3YXL0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc170D3YXL0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms