Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Ube2d4D3YUH6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms