Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Abcc8B2RUS7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Abcc8B2RUS7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms