Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Spocd1B1ASB6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms