Protein–RNA interactions for Protein: A9Z055

H2al2b, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al2bA9Z055 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al2bA9Z055 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms