Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Atp8b5A3FIN4 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Atp8b5A3FIN4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Atp8b5A3FIN4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Atp8b5A3FIN4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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