Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ambra1A2AH22 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms