Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Col9a3A2ACT7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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