Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PtprfA2A8L5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms