Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm5114W4VSN8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm5114W4VSN8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm5114W4VSN8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm5114W4VSN8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm5114W4VSN8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gm5114W4VSN8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm5114W4VSN8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm5114W4VSN8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm5114W4VSN8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm5114W4VSN8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm5114W4VSN8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm5114W4VSN8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm5114W4VSN8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm5114W4VSN8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm5114W4VSN8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Gm5114W4VSN8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gm5114W4VSN8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm5114W4VSN8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm5114W4VSN8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm5114W4VSN8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gm5114W4VSN8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm5114W4VSN8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm5114W4VSN8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm5114W4VSN8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gm5114W4VSN8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms