Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Homer1Q9Z2Y3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Homer1Q9Z2Y3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Homer1Q9Z2Y3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Homer1Q9Z2Y3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Homer1Q9Z2Y3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Homer1Q9Z2Y3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Homer1Q9Z2Y3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Homer1Q9Z2Y3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Homer1Q9Z2Y3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Homer1Q9Z2Y3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Homer1Q9Z2Y3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Homer1Q9Z2Y3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Homer1Q9Z2Y3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Homer1Q9Z2Y3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Homer1Q9Z2Y3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Homer1Q9Z2Y3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Homer1Q9Z2Y3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Homer1Q9Z2Y3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Homer1Q9Z2Y3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Homer1Q9Z2Y3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Homer1Q9Z2Y3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Homer1Q9Z2Y3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Homer1Q9Z2Y3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Homer1Q9Z2Y3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Homer1Q9Z2Y3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Homer1Q9Z2Y3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Homer1Q9Z2Y3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Homer1Q9Z2Y3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Homer1Q9Z2Y3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Homer1Q9Z2Y3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Homer1Q9Z2Y3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Homer1Q9Z2Y3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Homer1Q9Z2Y3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Homer1Q9Z2Y3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Homer1Q9Z2Y3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Homer1Q9Z2Y3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Homer1Q9Z2Y3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Homer1Q9Z2Y3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Homer1Q9Z2Y3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Homer1Q9Z2Y3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Homer1Q9Z2Y3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Homer1Q9Z2Y3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Homer1Q9Z2Y3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Homer1Q9Z2Y3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Homer1Q9Z2Y3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Homer1Q9Z2Y3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Homer1Q9Z2Y3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Homer1Q9Z2Y3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Homer1Q9Z2Y3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Homer1Q9Z2Y3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Homer1Q9Z2Y3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Homer1Q9Z2Y3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Homer1Q9Z2Y3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Homer1Q9Z2Y3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Homer1Q9Z2Y3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Homer1Q9Z2Y3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Homer1Q9Z2Y3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Homer1Q9Z2Y3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Homer1Q9Z2Y3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Homer1Q9Z2Y3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Homer1Q9Z2Y3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Homer1Q9Z2Y3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Homer1Q9Z2Y3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Homer1Q9Z2Y3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Homer1Q9Z2Y3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Homer1Q9Z2Y3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Homer1Q9Z2Y3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Homer1Q9Z2Y3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Homer1Q9Z2Y3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Homer1Q9Z2Y3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Homer1Q9Z2Y3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Homer1Q9Z2Y3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Homer1Q9Z2Y3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Homer1Q9Z2Y3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Homer1Q9Z2Y3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.2 ms