Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Knop1Q9Z2Q2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Knop1Q9Z2Q2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Knop1Q9Z2Q2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Knop1Q9Z2Q2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Knop1Q9Z2Q2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 301.7 ms