Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ilf3Q9Z1X4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ilf3Q9Z1X4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ilf3Q9Z1X4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ilf3Q9Z1X4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ilf3Q9Z1X4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ilf3Q9Z1X4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ilf3Q9Z1X4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ilf3Q9Z1X4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ilf3Q9Z1X4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ilf3Q9Z1X4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms