Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Ap3b1Q9Z1T1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ap3b1Q9Z1T1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ap3b1Q9Z1T1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Ap3b1Q9Z1T1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Ap3b1Q9Z1T1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Ap3b1Q9Z1T1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ap3b1Q9Z1T1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ap3b1Q9Z1T1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ap3b1Q9Z1T1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Ap3b1Q9Z1T1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ap3b1Q9Z1T1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ap3b1Q9Z1T1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Ap3b1Q9Z1T1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Ap3b1Q9Z1T1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ap3b1Q9Z1T1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ap3b1Q9Z1T1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Ap3b1Q9Z1T1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Ap3b1Q9Z1T1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ap3b1Q9Z1T1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ap3b1Q9Z1T1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Ap3b1Q9Z1T1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Ap3b1Q9Z1T1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ap3b1Q9Z1T1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ap3b1Q9Z1T1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Ap3b1Q9Z1T1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ap3b1Q9Z1T1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ap3b1Q9Z1T1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Ap3b1Q9Z1T1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Ap3b1Q9Z1T1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ap3b1Q9Z1T1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Ap3b1Q9Z1T1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ap3b1Q9Z1T1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ap3b1Q9Z1T1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Ap3b1Q9Z1T1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ap3b1Q9Z1T1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Ap3b1Q9Z1T1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Ap3b1Q9Z1T1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ap3b1Q9Z1T1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Ap3b1Q9Z1T1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ap3b1Q9Z1T1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
Ap3b1Q9Z1T1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ap3b1Q9Z1T1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ap3b1Q9Z1T1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Ap3b1Q9Z1T1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
Ap3b1Q9Z1T1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Ap3b1Q9Z1T1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ap3b1Q9Z1T1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Ap3b1Q9Z1T1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Ap3b1Q9Z1T1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Ap3b1Q9Z1T1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ap3b1Q9Z1T1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ap3b1Q9Z1T1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Ap3b1Q9Z1T1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ap3b1Q9Z1T1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ap3b1Q9Z1T1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ap3b1Q9Z1T1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ap3b1Q9Z1T1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ap3b1Q9Z1T1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ap3b1Q9Z1T1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Ap3b1Q9Z1T1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ap3b1Q9Z1T1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ap3b1Q9Z1T1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Ap3b1Q9Z1T1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Ap3b1Q9Z1T1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ap3b1Q9Z1T1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Ap3b1Q9Z1T1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
Ap3b1Q9Z1T1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ap3b1Q9Z1T1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Ap3b1Q9Z1T1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ap3b1Q9Z1T1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
Ap3b1Q9Z1T1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Ap3b1Q9Z1T1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ap3b1Q9Z1T1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ap3b1Q9Z1T1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Ap3b1Q9Z1T1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Ap3b1Q9Z1T1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ap3b1Q9Z1T1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Ap3b1Q9Z1T1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Ap3b1Q9Z1T1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ap3b1Q9Z1T1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Ap3b1Q9Z1T1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms