Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0U0

Xpr1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xpr1Q9Z0U0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xpr1Q9Z0U0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xpr1Q9Z0U0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Xpr1Q9Z0U0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xpr1Q9Z0U0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xpr1Q9Z0U0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xpr1Q9Z0U0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xpr1Q9Z0U0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Xpr1Q9Z0U0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Xpr1Q9Z0U0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Xpr1Q9Z0U0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Xpr1Q9Z0U0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Xpr1Q9Z0U0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Xpr1Q9Z0U0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Xpr1Q9Z0U0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms