Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn3Q9Z0G9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cldn3Q9Z0G9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cldn3Q9Z0G9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cldn3Q9Z0G9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms