Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pmfbp1Q9WVQ0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pmfbp1Q9WVQ0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pmfbp1Q9WVQ0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pmfbp1Q9WVQ0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Pmfbp1Q9WVQ0 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pmfbp1Q9WVQ0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pmfbp1Q9WVQ0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pmfbp1Q9WVQ0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms