Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pacsin2Q9WVE8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pacsin2Q9WVE8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pacsin2Q9WVE8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pacsin2Q9WVE8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pacsin2Q9WVE8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pacsin2Q9WVE8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pacsin2Q9WVE8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pacsin2Q9WVE8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pacsin2Q9WVE8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pacsin2Q9WVE8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pacsin2Q9WVE8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pacsin2Q9WVE8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pacsin2Q9WVE8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pacsin2Q9WVE8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pacsin2Q9WVE8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pacsin2Q9WVE8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pacsin2Q9WVE8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pacsin2Q9WVE8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pacsin2Q9WVE8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pacsin2Q9WVE8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pacsin2Q9WVE8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pacsin2Q9WVE8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pacsin2Q9WVE8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pacsin2Q9WVE8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pacsin2Q9WVE8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pacsin2Q9WVE8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pacsin2Q9WVE8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pacsin2Q9WVE8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pacsin2Q9WVE8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pacsin2Q9WVE8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pacsin2Q9WVE8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pacsin2Q9WVE8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Pacsin2Q9WVE8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Pacsin2Q9WVE8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacsin2Q9WVE8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacsin2Q9WVE8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacsin2Q9WVE8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacsin2Q9WVE8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacsin2Q9WVE8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacsin2Q9WVE8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pacsin2Q9WVE8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pacsin2Q9WVE8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pacsin2Q9WVE8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pacsin2Q9WVE8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms