Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx1Q9WV80 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx1Q9WV80 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx1Q9WV80 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Snx1Q9WV80 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx1Q9WV80 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx1Q9WV80 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx1Q9WV80 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx1Q9WV80 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Snx1Q9WV80 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx1Q9WV80 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx1Q9WV80 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx1Q9WV80 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Snx1Q9WV80 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx1Q9WV80 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx1Q9WV80 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx1Q9WV80 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Snx1Q9WV80 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Snx1Q9WV80 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Snx1Q9WV80 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Snx1Q9WV80 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Snx1Q9WV80 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms