Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
VapaQ9WV55 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VapaQ9WV55 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
VapaQ9WV55 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VapaQ9WV55 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VapaQ9WV55 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
VapaQ9WV55 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VapaQ9WV55 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VapaQ9WV55 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
VapaQ9WV55 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VapaQ9WV55 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
VapaQ9WV55 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VapaQ9WV55 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VapaQ9WV55 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
VapaQ9WV55 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VapaQ9WV55 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VapaQ9WV55 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VapaQ9WV55 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VapaQ9WV55 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms