Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnip1Q9WUU8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnip1Q9WUU8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnip1Q9WUU8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tnip1Q9WUU8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnip1Q9WUU8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnip1Q9WUU8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnip1Q9WUU8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnip1Q9WUU8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tnip1Q9WUU8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tnip1Q9WUU8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnip1Q9WUU8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tnip1Q9WUU8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnip1Q9WUU8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnip1Q9WUU8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnip1Q9WUU8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tnip1Q9WUU8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnip1Q9WUU8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tnip1Q9WUU8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnip1Q9WUU8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnip1Q9WUU8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnip1Q9WUU8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnip1Q9WUU8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnip1Q9WUU8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnip1Q9WUU8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tnip1Q9WUU8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tnip1Q9WUU8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Tnip1Q9WUU8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnip1Q9WUU8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnip1Q9WUU8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnip1Q9WUU8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tnip1Q9WUU8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnip1Q9WUU8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tnip1Q9WUU8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnip1Q9WUU8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tnip1Q9WUU8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tnip1Q9WUU8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnip1Q9WUU8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tnip1Q9WUU8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tnip1Q9WUU8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tnip1Q9WUU8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnip1Q9WUU8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnip1Q9WUU8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tnip1Q9WUU8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnip1Q9WUU8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnip1Q9WUU8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tnip1Q9WUU8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnip1Q9WUU8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnip1Q9WUU8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnip1Q9WUU8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnip1Q9WUU8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnip1Q9WUU8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tnip1Q9WUU8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnip1Q9WUU8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tnip1Q9WUU8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnip1Q9WUU8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnip1Q9WUU8 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tnip1Q9WUU8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnip1Q9WUU8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnip1Q9WUU8 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnip1Q9WUU8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tnip1Q9WUU8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tnip1Q9WUU8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms