Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTU3

Scn8a, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn8aQ9WTU3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scn8aQ9WTU3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Scn8aQ9WTU3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Scn8aQ9WTU3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Scn8aQ9WTU3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn8aQ9WTU3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms