Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vax2Q9WTP9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Vax2Q9WTP9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Vax2Q9WTP9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vax2Q9WTP9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms