Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpk1Q9R0M5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpk1Q9R0M5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tpk1Q9R0M5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpk1Q9R0M5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tpk1Q9R0M5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpk1Q9R0M5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpk1Q9R0M5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpk1Q9R0M5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpk1Q9R0M5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpk1Q9R0M5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tpk1Q9R0M5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpk1Q9R0M5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tpk1Q9R0M5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tpk1Q9R0M5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tpk1Q9R0M5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpk1Q9R0M5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpk1Q9R0M5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tpk1Q9R0M5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpk1Q9R0M5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpk1Q9R0M5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpk1Q9R0M5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tpk1Q9R0M5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpk1Q9R0M5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpk1Q9R0M5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpk1Q9R0M5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tpk1Q9R0M5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpk1Q9R0M5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpk1Q9R0M5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpk1Q9R0M5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpk1Q9R0M5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpk1Q9R0M5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tpk1Q9R0M5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.7 ms