Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Plod3Q9R0E1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Plod3Q9R0E1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Plod3Q9R0E1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Plod3Q9R0E1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Plod3Q9R0E1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Plod3Q9R0E1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Plod3Q9R0E1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Plod3Q9R0E1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Plod3Q9R0E1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Plod3Q9R0E1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Plod3Q9R0E1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Plod3Q9R0E1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Plod3Q9R0E1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Plod3Q9R0E1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Plod3Q9R0E1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Plod3Q9R0E1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Plod3Q9R0E1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Plod3Q9R0E1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Plod3Q9R0E1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Plod3Q9R0E1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Plod3Q9R0E1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Plod3Q9R0E1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Plod3Q9R0E1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Plod3Q9R0E1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms