Protein–RNA interactions for Protein: Q9R078

Prkab1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkab1Q9R078 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prkab1Q9R078 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Prkab1Q9R078 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Prkab1Q9R078 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prkab1Q9R078 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Prkab1Q9R078 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prkab1Q9R078 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Prkab1Q9R078 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prkab1Q9R078 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prkab1Q9R078 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Prkab1Q9R078 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Prkab1Q9R078 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prkab1Q9R078 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prkab1Q9R078 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prkab1Q9R078 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prkab1Q9R078 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Prkab1Q9R078 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Prkab1Q9R078 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prkab1Q9R078 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prkab1Q9R078 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prkab1Q9R078 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Prkab1Q9R078 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prkab1Q9R078 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prkab1Q9R078 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Prkab1Q9R078 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Prkab1Q9R078 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Prkab1Q9R078 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkab1Q9R078 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkab1Q9R078 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkab1Q9R078 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkab1Q9R078 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Prkab1Q9R078 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkab1Q9R078 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkab1Q9R078 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkab1Q9R078 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkab1Q9R078 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkab1Q9R078 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Prkab1Q9R078 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Prkab1Q9R078 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Prkab1Q9R078 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Prkab1Q9R078 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prkab1Q9R078 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prkab1Q9R078 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prkab1Q9R078 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Prkab1Q9R078 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prkab1Q9R078 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prkab1Q9R078 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Prkab1Q9R078 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Prkab1Q9R078 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms