Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copg1Q9QZE5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Copg1Q9QZE5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Copg1Q9QZE5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Copg1Q9QZE5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Copg1Q9QZE5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Copg1Q9QZE5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.9 ms