Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bcl11aQ9QYE3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bcl11aQ9QYE3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bcl11aQ9QYE3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bcl11aQ9QYE3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bcl11aQ9QYE3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bcl11aQ9QYE3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bcl11aQ9QYE3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bcl11aQ9QYE3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bcl11aQ9QYE3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bcl11aQ9QYE3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bcl11aQ9QYE3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bcl11aQ9QYE3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Bcl11aQ9QYE3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Bcl11aQ9QYE3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Bcl11aQ9QYE3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Bcl11aQ9QYE3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms