Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Kcnip3Q9QXT8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Kcnip3Q9QXT8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Kcnip3Q9QXT8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms