Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim44Q9QXA7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim44Q9QXA7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim44Q9QXA7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim44Q9QXA7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim44Q9QXA7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim44Q9QXA7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim44Q9QXA7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim44Q9QXA7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim44Q9QXA7 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim44Q9QXA7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim44Q9QXA7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim44Q9QXA7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim44Q9QXA7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim44Q9QXA7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim44Q9QXA7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim44Q9QXA7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim44Q9QXA7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim44Q9QXA7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim44Q9QXA7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim44Q9QXA7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim44Q9QXA7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim44Q9QXA7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim44Q9QXA7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms