Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX96

Sall2, Sal-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall2Q9QX96 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Sall2Q9QX96 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Sall2Q9QX96 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Sall2Q9QX96 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Sall2Q9QX96 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Sall2Q9QX96 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Sall2Q9QX96 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Sall2Q9QX96 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Sall2Q9QX96 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Sall2Q9QX96 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
Sall2Q9QX96 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Sall2Q9QX96 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Sall2Q9QX96 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Sall2Q9QX96 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
Sall2Q9QX96 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Sall2Q9QX96 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Sall2Q9QX96 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Sall2Q9QX96 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Sall2Q9QX96 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Sall2Q9QX96 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Sall2Q9QX96 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Sall2Q9QX96 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Sall2Q9QX96 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Sall2Q9QX96 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Sall2Q9QX96 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Sall2Q9QX96 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Sall2Q9QX96 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Sall2Q9QX96 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Sall2Q9QX96 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Sall2Q9QX96 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Sall2Q9QX96 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Sall2Q9QX96 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Sall2Q9QX96 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Sall2Q9QX96 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Sall2Q9QX96 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Sall2Q9QX96 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Sall2Q9QX96 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Sall2Q9QX96 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Sall2Q9QX96 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Sall2Q9QX96 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Sall2Q9QX96 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Sall2Q9QX96 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Sall2Q9QX96 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Sall2Q9QX96 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Sall2Q9QX96 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Sall2Q9QX96 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Sall2Q9QX96 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Sall2Q9QX96 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Sall2Q9QX96 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Sall2Q9QX96 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Sall2Q9QX96 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Sall2Q9QX96 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Sall2Q9QX96 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Sall2Q9QX96 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sall2Q9QX96 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Sall2Q9QX96 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Sall2Q9QX96 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Sall2Q9QX96 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Sall2Q9QX96 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Sall2Q9QX96 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Sall2Q9QX96 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Sall2Q9QX96 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Sall2Q9QX96 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Sall2Q9QX96 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Sall2Q9QX96 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Sall2Q9QX96 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Sall2Q9QX96 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Sall2Q9QX96 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Sall2Q9QX96 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Sall2Q9QX96 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Sall2Q9QX96 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms