Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMB0

Gkap1, G kinase-anchoring protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gkap1Q9JMB0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gkap1Q9JMB0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gkap1Q9JMB0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gkap1Q9JMB0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gkap1Q9JMB0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms