Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dclk1Q9JLM8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dclk1Q9JLM8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dclk1Q9JLM8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dclk1Q9JLM8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dclk1Q9JLM8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dclk1Q9JLM8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dclk1Q9JLM8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dclk1Q9JLM8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dclk1Q9JLM8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dclk1Q9JLM8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dclk1Q9JLM8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dclk1Q9JLM8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dclk1Q9JLM8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Dclk1Q9JLM8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dclk1Q9JLM8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dclk1Q9JLM8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dclk1Q9JLM8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dclk1Q9JLM8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dclk1Q9JLM8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dclk1Q9JLM8 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dclk1Q9JLM8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Dclk1Q9JLM8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dclk1Q9JLM8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dclk1Q9JLM8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Dclk1Q9JLM8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dclk1Q9JLM8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dclk1Q9JLM8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Dclk1Q9JLM8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Dclk1Q9JLM8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms