Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FancaQ9JL70 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
FancaQ9JL70 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
FancaQ9JL70 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
FancaQ9JL70 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FancaQ9JL70 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
FancaQ9JL70 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
FancaQ9JL70 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FancaQ9JL70 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
FancaQ9JL70 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
FancaQ9JL70 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
FancaQ9JL70 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
FancaQ9JL70 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FancaQ9JL70 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
FancaQ9JL70 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FancaQ9JL70 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
FancaQ9JL70 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
FancaQ9JL70 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
FancaQ9JL70 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FancaQ9JL70 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
FancaQ9JL70 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FancaQ9JL70 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
FancaQ9JL70 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
FancaQ9JL70 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
FancaQ9JL70 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
FancaQ9JL70 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FancaQ9JL70 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
FancaQ9JL70 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FancaQ9JL70 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
FancaQ9JL70 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FancaQ9JL70 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
FancaQ9JL70 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FancaQ9JL70 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
FancaQ9JL70 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
FancaQ9JL70 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FancaQ9JL70 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FancaQ9JL70 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
FancaQ9JL70 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
FancaQ9JL70 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FancaQ9JL70 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
FancaQ9JL70 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FancaQ9JL70 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
FancaQ9JL70 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FancaQ9JL70 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
FancaQ9JL70 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
FancaQ9JL70 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
FancaQ9JL70 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
FancaQ9JL70 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FancaQ9JL70 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FancaQ9JL70 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
FancaQ9JL70 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FancaQ9JL70 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
FancaQ9JL70 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FancaQ9JL70 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FancaQ9JL70 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FancaQ9JL70 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FancaQ9JL70 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
FancaQ9JL70 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
FancaQ9JL70 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
FancaQ9JL70 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
FancaQ9JL70 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FancaQ9JL70 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
FancaQ9JL70 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FancaQ9JL70 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FancaQ9JL70 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
FancaQ9JL70 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FancaQ9JL70 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FancaQ9JL70 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FancaQ9JL70 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
FancaQ9JL70 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
FancaQ9JL70 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FancaQ9JL70 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FancaQ9JL70 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
FancaQ9JL70 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FancaQ9JL70 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
FancaQ9JL70 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
FancaQ9JL70 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
FancaQ9JL70 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms