Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stx6Q9JKK1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stx6Q9JKK1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Stx6Q9JKK1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx6Q9JKK1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx6Q9JKK1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx6Q9JKK1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx6Q9JKK1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx6Q9JKK1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Stx6Q9JKK1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stx6Q9JKK1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Stx6Q9JKK1 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stx6Q9JKK1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Stx6Q9JKK1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Stx6Q9JKK1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stx6Q9JKK1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stx6Q9JKK1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Stx6Q9JKK1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stx6Q9JKK1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stx6Q9JKK1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stx6Q9JKK1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stx6Q9JKK1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Stx6Q9JKK1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stx6Q9JKK1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stx6Q9JKK1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stx6Q9JKK1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stx6Q9JKK1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stx6Q9JKK1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Stx6Q9JKK1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stx6Q9JKK1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stx6Q9JKK1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Stx6Q9JKK1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stx6Q9JKK1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Stx6Q9JKK1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Stx6Q9JKK1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Stx6Q9JKK1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Stx6Q9JKK1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms