Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cyp39a1Q9JKJ9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyp39a1Q9JKJ9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cyp39a1Q9JKJ9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.9 ms