Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mrpl39Q9JKF7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Mrpl39Q9JKF7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Mrpl39Q9JKF7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms