Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Trem3Q9JKE1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trem3Q9JKE1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trem3Q9JKE1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms