Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ap4m1Q9JKC7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ap4m1Q9JKC7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ap4m1Q9JKC7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms