Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF2

Spag4, Sperm-associated antigen 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spag4Q9JJF2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Spag4Q9JJF2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Spag4Q9JJF2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spag4Q9JJF2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spag4Q9JJF2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Spag4Q9JJF2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Spag4Q9JJF2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Spag4Q9JJF2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Spag4Q9JJF2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spag4Q9JJF2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spag4Q9JJF2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Spag4Q9JJF2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms