Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJC6

Rilpl1, RILP-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rilpl1Q9JJC6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rilpl1Q9JJC6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rilpl1Q9JJC6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rilpl1Q9JJC6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rilpl1Q9JJC6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rilpl1Q9JJC6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rilpl1Q9JJC6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rilpl1Q9JJC6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rilpl1Q9JJC6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rilpl1Q9JJC6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rilpl1Q9JJC6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rilpl1Q9JJC6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rilpl1Q9JJC6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rilpl1Q9JJC6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms