Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Smco4Q9JIS3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Smco4Q9JIS3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smco4Q9JIS3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smco4Q9JIS3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms